根据2017年7月学校官网显示，学校下设20个学院，7所直属附属医院和10所非直属附属医院，开设本科招生专业20个。
| 类别 | 名称 | |
|---|---|---|
| 教学机构 | 广州医科大学研究生院 | 广州医科大学基础学院 |
| 广州医科大学卫生管理学院 | 广州医科大学公共卫生学院 | |
| 广州医科大学第一临床学院 | 广州医科大学第二临床学院 | |
| 广州医科大学第三临床学院 | 广州医科大学第五临床学院 | |
| 广州医科大学第六临床学院 | 广州医科大学全科医学与继续教育学院 | |
| 广州医科大学护理学院 | 广州医科大学国际教育学院 | |
| 广州医科大学口腔医学院 | 广州医科大学药学院 | |
| 广州医科大学金域检验学院 | 广州医科大学南山学院 | |
| 广医-广州生物院联合生科院 | 广州医科大学思想政治理论课教学部 | |
| 广州医科大学精神卫生学院 | 广州医科大学儿科学院 | |
| 广州市一临床学院 | --- | |
| 直属附属医院 | 广州医科大学附属第一医院 | 广州医科大学附属第二医院 |
| 广州医科大学附属第三医院 | 广州医科大学附属第五医院 | |
| 广州医科大学附属顺德医院 | 广州医科大学附属肿瘤医院 | |
| 广州医科大学附属口腔医院 | --- | |
根据2017年7月学校官网显示，学校下设20个学院，7所直属附属医院和10所非直属附属医院，开设本科招生专业20个。
| 院系 | 专业 | 学制 |
|---|---|---|
| 第一临床学院 | 临床医学 | 五年 |
| 中西医临床医学 | 五年 | |
| 第二临床学院 | 临床医学 | 五年 |
| 麻醉学 | 五年 | |
| 医学影像学 | 五年 | |
| 第三临床学院 | 临床医学 | 五年 |
| 第五临床学院 | 康复治疗学 | 五年 |
| 公共卫生学院 | 食品质量与安全 | 四年 |
| 统计学 | 四年 | |
| 预防医学 | 五年 | |
| 护理学院 | 护理学 | 四年 |
| 基础学院 | 生物技术 | 四年 |
| 生物科学 | 四年 | |
| 生物医学工程 | 四年 | |
| 信息管理与信息系统 | 四年 | |
| 金域检验学院 | 医学检验技术 | 四年 |
| 口腔医学院 | 口腔医学 | 五年 |
| 卫生管理学院 | 法学 | 四年 |
| 公共事业管理 | 四年 | |
| 市场营销 | 四年 | |
| 应用心理学 | 四年 [18] | |
| 药学院 | 临床药学 | 五年 |
| 药学 | 四年 |
| 1 | 医学影像学 | 4.4 (197人) |
| 2 | 市场营销 | 4.3 (44人) |
| 3 | 口腔医学 | 4.3 (138人) |
| 4 | 麻醉学 | 4.3 (113人) |
| 5 | 口腔医学 | 4.2 (207人) |
| 6 | 护理 | 4.1 (1444人) |
| 7 | 康复治疗技术 | 4.1 (126人) |
| 8 | 临床医学 | 4.1 (1076人) |
| 9 | 康复治疗学 | 4.1 (132人) |
| 10 | 医学检验技术 | 4.0 (265人) |