学校始建于1958年，校名为“津沧医学专科学校”；1963年更名为“河北省沧州卫生学校”；1994年被评为“国家级普通重点中专学校”，是当时全国医药卫生系统17所国家级重点中专学校之一；2001年4月，经河北省教育厅批准成为“河北医科大学沧州分校”，招收专科层次学生；2004年5月经国家教育部批准，改建为“沧州医学高等专科学校”。2004年9月在沧州市高教区建成新校区并投入使用。