学校的前身是1956年国家城市建设部创建的长春城市建设工程学校，是吉林省第一所土建类中等专业学校，也是新中国首批建立的十所建筑类专门学校之一。1960年升格为本科院校，正式成立“吉林建筑工程学院”，成为吉林省唯一的土建类本科高等学校。1962年，在贯彻国民经济调整“八字”方针的背景下，吉林建筑工程学院停办并改回中专。1978年12月，经国务院批准，学校复名为吉林建筑工程学院。恢复本科建制后，学校采取有力措施，积极充实和改善办学条件，大力加强师资队伍建设，加速推进学科专业建设，不断深化教学改革，办学规模逐步扩大，办学质量明显提升。1997年，学校顺利通过了国家教育部本科教学工作合格评价，2003年，成功取得硕士学位授予权。