国家二级重点学科
作物遗传育种：该学科由中国著名的稻作学家丁颖院士创立，在稻种遗传资源的收集、整理、研究和水稻育种等方面取得了突出成就。
农业昆虫与害虫防治：是华农第一个国家重点学科，其昆虫毒理学与植物质杀虫剂研究，昆虫生态学与害虫种群动态控制研究，瓢虫等天敌昆虫的分类及利用研究，昆虫抗菌肽研究等在国内外有重大影响。
农业经济管理：位列广东经济管理学科点前茅，拥有两个省级人文社科重点研究基地。
果树学：拥有广东省果蔬保鲜重点实验室，热带亚特带水果研究室和果蔬采后生理研
究室等专业研究机构。
预防兽医学：其前身是“八五”期间重点建设的养禽和禽病学科，已拥有抗击“非典”
和禽流感英雄辛朝安，珠江学者廖明等一批强大的科研队伍。
7个获批攀峰重点学科的一级学科：农业工程，食品科学与工程、作物学，园艺学，植物保护，兽医学，农林经济管理；5个获批优势重点学科的一级学科：生物学，生态学，畜牧学，林学，农业资源与环境。
农业机械化工程
金融学，应用数学，应用化学，木材科学与技术等(不含一级学科重点学科下的二级学科)。
电子信息工程，计算机科学与技术，机械设计制造及其自动化，交通运输，应用化学，动物科学，生物技术，动物医学，食品科学与工程。
国家特色专业(12个)
农业机械化及其自动化，植物保护，农林经济管理，生物技术，动物科学，食品科学与工程，农学，园艺，动物医学，茶学，食品质量与安全，林学。
林业局重点学科
植物学
