截止2019年11月，学校设有19个学院(部)，62个本科专业。
| 二级学院 | 开设专业 |
|---|---|
| 重庆交通大学土木工程学院 | 土木类(道路桥梁与渡河工程、土木工程) |
| 安全工程 | |
| 工程力学 | |
| 测绘工程 | |
| 重庆交通大学河海学院 | 水利类(水利水电工程、港口航道与海岸工程) |
| 地质工程 | |
| 给排水科学与工程 | |
| 环境科学 | |
| 环境科学与工程 | |
| 重庆交通大学交通运输学院 | 交通运输类(交通运输、交通工程、交通设备与控制工程) |
| 汽车服务工程 | |
| 交通管理 | |
| 重庆交通大学建筑与城市规划学院 | 建筑类(建筑学、风景园林、城乡规划) |
| 地理科学类(人文地理与城乡规划、地理信息科学) | |
| 重庆交通大学机电与车辆工程学院 | 机械类(机械设计制造及自动化、材料成型及控制工程、机械电子工程、车辆工程) |
| 电气工程及其自动化 | |
| 能源与动力工程 | |
| 重庆交通大学信息科学与工程学院 | 电子信息类(电子信息工程、通信工程) |
| 计算机类(计算机科学与技术、物联网工程) | |
| 人工智能 | |
| 数据科学与大数据技术 | |
| 重庆交通大学航运与船舶工程学院 | 轮机工程 |
| 航海技术 | |
| 船舶电子电气工程 | |
| 船舶与海洋工程 | |
| 重庆交通大学材料科学与工程学院 | 材料类(材料科学与工程、材料物理) |
| 应用化学 | |
| 重庆交通大学经济与管理学院 | 管理科学与工程类(工程管理、工程造价、信息管理与信息系统) |
| 物流管理 | |
| 工商管理类(工商管理、会计学、市场营销) | |
| 经济学 | |
| 国际经济与贸易 | |
| 知识产权 | |
| 重庆交通大学数学与统计学院 | 数学类(数学与应用数学、信息与计算科学) |
| 应用统计学 | |
| 重庆交通大学外国语学院 | 外国语言文学类(英语、翻译) |
| 重庆交通大学人文学院(长江旅游学院) | 新闻传播学类(广播电视学、广告学) |
| 旅游管理 | |
| 汉语国际教育 | |
| 重庆交通大学艺术设计学院(马蒂亚斯国际设计学院) | 设计学类(视觉传达设计、产品设计、环境设计) |
| 工业设计 | |
| 重庆交通大学国际学院 | 土木工程(与英国伦敦南岸大学合作举办本科教育项目) |
| 机械设计制造及自动化(与英国诺森比亚大学合作举办本科教育项目) | |
重庆交通大学航空学院(重庆航空学院) | 飞行器制造工程 |
| 飞行器动力工程 | |
| 重庆交通大学马克思主义学院 | / |
| 重庆交通大学体育部 | / |
| 重庆交通大学应用技术学院 | (现已停止招生办学) |
| 重庆交通大学继续教育学院 | / |
截止2019年11月，学校设有19个学院(部)，62个本科专业。
| 二级学院 | 开设专业 |
|---|---|
| 重庆交通大学土木工程学院 | 土木类(道路桥梁与渡河工程、土木工程) |
| 安全工程 | |
| 工程力学 | |
| 测绘工程 | |
| 重庆交通大学河海学院 | 水利类(水利水电工程、港口航道与海岸工程) |
| 地质工程 | |
| 给排水科学与工程 | |
| 环境科学 | |
| 环境科学与工程 | |
| 重庆交通大学交通运输学院 | 交通运输类(交通运输、交通工程、交通设备与控制工程) |
| 汽车服务工程 | |
| 交通管理 | |
| 重庆交通大学建筑与城市规划学院 | 建筑类(建筑学、风景园林、城乡规划) |
| 地理科学类(人文地理与城乡规划、地理信息科学) | |
| 重庆交通大学机电与车辆工程学院 | 机械类(机械设计制造及自动化、材料成型及控制工程、机械电子工程、车辆工程) |
| 电气工程及其自动化 | |
| 能源与动力工程 | |
| 重庆交通大学信息科学与工程学院 | 电子信息类(电子信息工程、通信工程) |
| 计算机类(计算机科学与技术、物联网工程) | |
| 人工智能 | |
| 数据科学与大数据技术 | |
| 重庆交通大学航运与船舶工程学院 | 轮机工程 |
| 航海技术 | |
| 船舶电子电气工程 | |
| 船舶与海洋工程 | |
| 重庆交通大学材料科学与工程学院 | 材料类(材料科学与工程、材料物理) |
| 应用化学 | |
| 重庆交通大学经济与管理学院 | 管理科学与工程类(工程管理、工程造价、信息管理与信息系统) |
| 物流管理 | |
| 工商管理类(工商管理、会计学、市场营销) | |
| 经济学 | |
| 国际经济与贸易 | |
| 知识产权 | |
| 重庆交通大学数学与统计学院 | 数学类(数学与应用数学、信息与计算科学) |
| 应用统计学 | |
| 重庆交通大学外国语学院 | 外国语言文学类(英语、翻译) |
| 重庆交通大学人文学院(长江旅游学院) | 新闻传播学类(广播电视学、广告学) |
| 旅游管理 | |
| 汉语国际教育 | |
| 重庆交通大学艺术设计学院(马蒂亚斯国际设计学院) | 设计学类(视觉传达设计、产品设计、环境设计) |
| 工业设计 | |
| 重庆交通大学国际学院 | 土木工程(与英国伦敦南岸大学合作举办本科教育项目) |
| 机械设计制造及自动化(与英国诺森比亚大学合作举办本科教育项目) | |
重庆交通大学航空学院(重庆航空学院) | 飞行器制造工程 |
| 飞行器动力工程 | |
| 重庆交通大学马克思主义学院 | / |
| 重庆交通大学体育部 | / |
| 重庆交通大学应用技术学院 | (现已停止招生办学) |
| 重庆交通大学继续教育学院 | / |
| 1 | 土木工程 | 4.8 (744人) |
| 2 | 港口航道与海岸工程 | 4.8 (442人) |
| 3 | 水利水电工程 | 4.6 (300人) |
| 4 | 工程管理 | 4.6 (275人) |
| 5 | 工程造价 | 4.8 (216人) |
| 6 | 会计学 | 4.2 (165人) |
| 7 | 土木类 | 4.8 (143人) |
| 8 | 建筑学 | 4.7 (118人) |
| 9 | 交通工程 | 4.7 (101人) |
| 10 | 给水排水工程 | 4.6 (101人) |