石河子大学有着60年的办学历史，建校最早的原石河子医学院前身诞生于 1949年9月中国人民解放军解放新疆的进军途中。在长期办学历程中，学校始终与祖国同呼吸、共命运，党中央、国务院高度重视和关心学校发展。周恩来总理、陈毅副总理、贺龙副总理、王震副主席等党和国家领导人曾亲临学校视察。中共中央〔2004〕11号文提出，加大对石河子大学的支持力度。2008年岁末，中共中央政治局委员、国务委员刘延东同志代表党中央、国务院写信向我校师生员工致以新年的慰问，并明确石河子大学进入国家“211工程”重点建设高校行列。