学校起步于1946年7月东北银行总行举办的银行干部训练班，以后经历了东北银行干部学校、东北银行专门学校、长春银行学校、吉林财贸学院、吉林省财贸学校等几个历史时期，1978年5月恢复吉林财贸学院，1992年5月更名为长春税务学院，2010年3月更名为吉林财经大学。学校曾是新中国创建的第一所金融高等学校、国家较早成立的普通本科财经院校之一、国家第一所税务本科大学。曾先后隶属于东北银行总行、中国人民银行、国家税务总局。曾先后在佳木斯市、哈尔滨市、沈阳市等地办学，1950年7月迁入长春市，现校址为长春市净月大街3699号。