济宁医学院前身是创建于1952年的山东省济宁医士学校，1958年改为济宁医学院，招收第一届本科生；1959年改为济宁医学专科学校； 1987年1月，经原国家教育委员会批准，更名为济宁医学院；2008年4月学校以“优秀”成绩顺利通过国家教育部本科教学工作水平评估。