| 年度 | 全国排名 | 省内排名 | 总分 |
| 2020 | 616 | 34 | 暂无 |
| 2019 | 696 | 40 | 60.22 |
| 2018 | 694 | 40 | 60.17 |
| 2017 | 695 | 40 | 60.13 |
| 2016 | 699 | 39 | 60.23 |
| 2015 | 690 | 39 | 60.26 |
| 2014 | 702 | 35 | 60 |
2020山东农业工程学院在山东省内排名第34名，排在山东农业工程学院前2位的是山东管理学院和齐鲁师范学院。
| 校友会2020山东省大学排名 | ||||
| 名次 | 学校名称 | 全国排名 | 星级排名 | 办学层次 |
| 1 | 山东大学 | 13 | 7★ | 世界知名高水平大学 |
| 2 | 中国海洋大学 | 41 | 6★ | 世界高水平大学 |
| 3 | 中国石油大学(华东) | 85 | 6★ | 世界高水平大学 |
| 4 | 齐鲁工业大学 | 96 | 4★ | 中国高水平大学 |
| 5 | 山东师范大学 | 99 | 4★ | 中国高水平大学 |
| 6 | 山东农业大学 | 126 | 4★ | 中国高水平大学 |
| 7 | 山东科技大学 | 137 | 3★ | 区域一流大学 |
| 8 | 山东财经大学 | 142 | 4★ | 中国高水平大学 |
| 9 | 青岛大学 | 167 | 3★ | 区域一流大学 |
| 10 | 济南大学 | 183 | 3★ | 区域一流大学 |
| 11 | 青岛科技大学 | 186 | 3★ | 区域一流大学 |
| 12 | 曲阜师范大学 | 207 | 2★ | 区域高水平大学 |
| 13 | 青岛理工大学 | 230 | 2★ | 区域高水平大学 |
| 14 | 山东理工大学 | 253 | 3★ | 区域一流大学 |
| 14 | 烟台大学 | 253 | 2★ | 区域高水平大学 |
| 16 | 聊城大学 | 275 | 2★ | 区域高水平大学 |
| 17 | 青岛农业大学 | 282 | 3★ | 区域一流大学 |
| 18 | 山东建筑大学 | 291 | 3★ | 区域一流大学 |
| 19 | 鲁东大学 | 296 | 2★ | 区域高水平大学 |
| 20 | 临沂大学 | 378 | 2★ | 区域高水平大学 |
| 21 | 山东工商学院 | 433 | 2★ | 区域高水平大学 |
| 22 | 山东交通学院 | 474 | 3★ | 区域一流大学 |
| 23 | 滨州学院 | 503 | 1★ | 区域知名大学 |
| 24 | 德州学院 | 510 | 1★ | 区域知名大学 |
| 25 | 潍坊学院 | 519 | 1★ | 区域知名大学 |
| 26 | 泰山学院 | 539 | 1★ | 区域知名大学 |
| 27 | 山东青年政治学院 | 545 | 1★ | 区域知名大学 |
| 28 | 枣庄学院 | 564 | 1★ | 区域知名大学 |
| 29 | 山东女子学院 | 580 | 1★ | 区域知名大学 |
| 30 | 济宁学院 | 585 | 1★ | 区域知名大学 |
| 31 | 菏泽学院 | 595 | 1★ | 区域知名大学 |
| 31 | 山东管理学院 | 595 | 1★ | 区域知名大学 |
| 33 | 齐鲁师范学院 | 600 | 1★ | 区域知名大学 |
| 34 | 山东农业工程学院 | 616 | 2★ | 区域高水平大学 |
| 山东第一医科大学 | 260 | 3★ | 区域一流大学 | |
| 山东中医药大学 | 290 | 3★ | 区域一流大学 | |
| 滨州医学院 | 420 | 2★ | 区域高水平大学 | |
| 潍坊医学院 | 455 | 2★ | 区域高水平大学 | |
| 山东工艺美术学院 | 465 | 3★ | 区域一流大学 | |
| 山东体育学院 | 470 | 3★ | 区域一流大学 | |
| 山东政法学院 | 490 | 3★ | 区域一流大学 | |
| 济宁医学院 | 490 | 1★ | 区域知名大学 | |
| 山东艺术学院 | 500 | 3★ | 区域一流大学 | |
| 山东警察学院 | 550 | 2★ | 区域高水平大学 | |