和县二中始建于一九四七年，其前身为和县私立新生中学，由王学华先生捐献新生洲土地150多亩筹建。1952年秋，学校由县人民政府接管，更名为和县初级中学;1969年1月，改名为和县卫东中学;1970年春，又改名为和县中学，开始设立高中部;1974年1月，该校定名为和县第二中学。上世纪80年代，学校规模为24个教学班，每年级4个班，教职工80余人。从1996年起，连续三年，初中增开一个六年一贯班，后，初中每年级增为6个班;高中从1997年起，每年级开设7个班。1998年学校创建成为巢湖地区规范完中，2000年创建为巢湖市第一所市级示范完中，2007年创建成为省级示范高中。
学校现有一座四层，条件先进的办公楼（1990年建成），两栋条件优越，功能齐全，能容纳1200名学生住校的学生公寓楼（2001、2008年建成），一幢2600平方米的师生餐厅（2008年建成），七幢206套的教职工住宅楼（第一幢于1998年建成，后五幢于2003年建成，第七幢建于2005年）。全新的理化生实验仪器设备、现代信息技术设备达教育部规定的中学一类标准，特别是物种齐全、形态逼真的生态园在全省仅有两家;体育、美术、音乐器材齐全;藏书近19万册，报刊杂志350余种。拥有计算机教室4个，微机280台，多媒体教室10个，电子阅览室、语言实验室、学术报告厅、音乐室、美工室各一个。开通了校园网，建立了天文观测台，于2002年加入了北大附中远程教育网，成为巢湖市唯一一所远程教育示范学校。
学校于1989年创办了一个生产丙衡纺织袋的专业工厂，通过扩建，厂房面积达1300多平方米，有65型拉丝机组1套，混炼造粒机1台，圆织机9台，工业缝纫机12台，固定资产180多万元，鼎盛时，管理人员6人，职工50人，年产值300万元，利税30万元。后因大环境影响，2000年底停产。