| 基础医学院 | 中医药学院 |
| 药学院 | 医学人文学院 |
| 公共卫生学院 | 全科医学与继续教育学院 |
| 护理学院 | 国际学院 |
| 生物医学工程学院 | 燕京医学院 |
| 马克思主义学部 | 附属卫生学校 |
| 神经外科学院 | 眼科学院 | 耳鼻咽喉科学院 | 神经病学系 |
| 儿科学系 | 口腔医学系 | 呼吸病学系 | 心血管病学系 |
| 消化病学系 | 麻醉学系 | 妇产科学系 | 皮肤病与性病学系 |
| 传染病学系 | 内分泌与代谢病学系 | 普通外科学系 | 急诊医学系 |
| 临床检验诊断学系 | 危重症医学系 | 医学影像学系 | 核医学系 |
| 血液病学系 | 老年医学系 | 精神病学系 | 临床心理学系 |
| 骨外科学系 | 中西医结合学系 | 康复医学系 | 中医临床学系 |
| 肾病学系 | 肿瘤学系 | 泌尿外科学系 | 风湿病学系 |
| 临床护理学院 | 超声医学系 | 胸外科学系 | 心脏外科学系 |
| 血管外科学系 | 临床病理学系 | -------- | -------- |
截至年6月，学校校开办24个本科专业、14个专科专业。
本科专业一览表
| 修业年限 | 修业年限 | 专业类 | 学位授予门类 |
|---|---|---|---|
| 临床医学(5+3 一体化) | 八年 | 临床医学类 | 医学 |
| 临床医学 | 五年 | 临床医学类 | 医学 |
| 临床医学(北京郊区定向) | 五年 | 临床医学类 | 医学 |
| 临床医学(留学生) | 六年制 | 临床医学类 | 医学 |
| 儿科学(5+3 一体化) | 八年 | 临床医学类 | 医学 |
| 儿科学 | 五年 | 临床医学类 | 医学 |
| 精神医学 | 五年 | 临床医学类 | 医学 |
| 眼视光医学 | 五年 | 临床医学类 | 医学 |
| 口腔医学(5+3 一体化) | 八年 | 口腔医学类 | 医学 |
| 口腔医学 | 五年 | 口腔医学类 | 医学 |
| 基础医学 | 五年 | 基础医学类 | 医学 |
| 预防医学 | 五年 | 公共卫生与预防医学类 | 医学 |
| 预防医学(北京郊区定向) | 五年 | 公共卫生与预防医学类 | 医学 |
| 中医学 | 五年 | 中医学类 | 医学 |
| 临床药学 | 五年 | 药学类 | 理学 |
| 药学 | 四年 | 药学类 | 理学 |
| 中药学 | 四年 | 中药学类 | 理学 |
| 护理学 | 四年 | 护理学类 | 理学 |
| 助产学 | 四年 | 护理学类 | 理学 |
| 生物医学工程 | 四年 | 生物医学工程类 | 工学 |
| 假肢矫形工程 | 四年 | 生物医学工程类 | 工学 |
| 康复治疗学 | 四年 | 医学技术类 | 理学 |
| 听力与言语康复学 | 四年 | 医学技术类 | 理学 |
| 医学检验技术 | 四年 | 医学技术类 | 理学 |
| 医学实验技术 | 四年 | 医学技术类 | 理学 |
| 医学影像技术 | 四年 | 医学技术类 | 理学 |
| 卫生检验与检疫 | 四年 | 医学技术类 | 理学 |
| 公共事业管理(卫生管理方向) | 四年 | 公共管理类 | 管理学 |
| 法学(卫生法学方向) | 四年 | 法学类 | 法学 |
| 信息管理与信息系统(卫生信息管理方向) | 四年 | 管理科学与工程类 | 管理学 |
| 专业名称 | 学制 |
|---|---|
| 临床医学(北京农村基层定向) | 三年制 |
| 临床医学(山区、半山区定向) | 三年制 |
| 临床医学(乡村医生) | 三年制 |
| 护理学 | 三年制 |
| 药学 | 三年制 |
| 医学检验技术 | 三年制 |
| 卫生信息管理 | 三年制 |
| 1 | 临床医学 | 4.5 (84人) |
| 2 | 预防医学 | 3.9 (42人) |
| 3 | 生物医学工程 | 3.8 (36人) |
| 4 | 公共事业管理 | 3.5 (34人) |
| 5 | 口腔医学 | 4.0 (28人) |