现有中国少数民族语言文学和动物学2个国家重点学科，生态学国家重点培育学科；有1个一级学科自治区重点学科，18个二级学科自治区重点学科，8个自治区重点培育学科。蒙古学和生命科学两个学科群具有鲜明的民族特色和地区特色，在国内外享有盛誉。