学院院长由上海海事大学选派具有多年高等教育经验，原任上海海事大学商船学院航海系主任赵仁余教授担任，原上海海事大学商船学院副院长陈宝忠教授任教学副院长，原上海海事大学老校区管委会常务副主任祝炳发副研究员担任行政副院长，并由上海海事大学选派优秀干部组建学院教学管理团队。同时，学院十分重视师资队伍建设，按照“公开招聘、择优录用、专兼结合”的原则选拔了一批德才兼备的优秀教师来我院任教。