学院的前身是新疆喀什师范专科学校。1962年上半年，自治区党委和人民政府对自治区大专院校进行调整，决定将原新疆师范学院和新疆大学合并，从中抽调部分教职员工、图书资料和仪器设备，在喀什市组建新疆喀什师范专科学校。1978年8月，经国家教育部批准，学校升格为本科院校，更名为喀什师范学院。2003年6月，经国务院学位委员会审核，我院获得硕士学位授权单位资格，开始承担硕士研究生培养任务。从建校到1979年底的17年间，学院是自治区5所高等院校（新疆大学、新疆工学院、八一农学院、新疆医学院、新疆喀什师范专科学校）中唯一的一所高等师范院校，在新疆教师教育和民族教育中，承前启后，发挥着重要的作用。