2个国家中医药管理局科研Ⅲ级实验室。教育部省部共建重点实验室--中药资源与中药复方实验室已批准立项建设；建有中药资源与中药化学省级重点实验室、省中药标准化工程技术研究中心、省实验教学示范中心、省中小企业共性技术（中药研发工程）推广中心、武汉市中药创新与规范化工程技术研究中心、武汉市超临界CO2萃取和大孔树脂纯化技术中试平台。还有10个院级研究所。在内经学、伤寒学、针灸学、中医药治疗肝病、心血管病、肾病、甲状腺病以及中医信息工程、中药资源与中药新药研究开发等领域具有较明显优势和特色。