山东交通学院前身为济南交通高等专科学校，始建于1956年。2000年2月由交通部划转山东省人民政府主管。2002年3月经教育部批准，济南交通高等专科学校与中国重汽集团职工大学合并组建山东交通学院，由省政府主管，实行省教育厅与省交通厅共管、以省教育厅为主的管理体制。2005年7月经省政府批准，将原山东省水运学校并入，学校成为山东省唯一一所以培养公路、水路交通运输专门人才为主的本科高校。为更好地支持学校的发展，2007年9月省政府与交通部签署了共建山东交通学院的意见。2009年省政府批准我校为山东省船舶与海洋工程专业人才教育培训基地；省教育厅批准我校为山东省首批研究生联合培养基地单位。