蚌埠医学院创建于1958年7月，由上海第二医学院和安徽医学院援建而成，是安徽省省属普通高等医学本科院校和国家首批具有学士和硕士学位授予权的单位。1968年8月，经安徽省革委会批准改称蚌埠反修医学院；1970年11月，安徽省革委会决定将安徽四所高等医学院校合并为安徽医学院，蚌埠反修医学院更名为安徽医学院蚌埠分院；1974年6月，国务院科教组发文通知恢复蚌埠医学院。