现有1个国家重点学科、3个上海高校一流学科（1个A类、2个B类）、12个省部级重点学科，5个国家特色专业、3门国家精品课程、17门上海市精品课程、2门上海市体育与健康教育精品课程、5门上海市示范性全英语教学课程、1个国家级和4个市级教学团队、1个国家级和2个市级实验教学示范中心，获4项一等奖、8项二等奖等上海市教学成果奖。“十二五”以来，学校在自然科学和人文哲社学科取得多项突破性的研究成果，在水产养殖、海洋渔业、水产品加工、食品安全、农产品低温物流、渔业经济管理等领域做出了重大贡献。获国家级科技进步奖2项、省部级奖20多项、上海市决策咨询奖3项等。