学校拥有省内唯一一家药物安全性评价中心，建立了黑龙江省中药材GAP研究中心；为“省医药工业校企合作专业委员会”牵头单位，与多家企业合作，成立了黑龙江中医药大学久久药业和黑龙江宝泉制药有限公司等校企联合的科技实业；建成了占地100万平方米的黑龙江中医药大学清河中药材种子种苗繁育基地，并在黑龙江省14个市、县建成中药材GAP示范基地。