现有国家重点实验室2个，省部重点(专业)实验室13个，国家研发中心4个，部省研发中心20个。
国家重点实验室（2个）
　　作物遗传改良国家重点实验室
　　农业微生物学国家重点实验室
国家专业实验室（2个）
　　国家兽药安全评价实验室
　　国家兽药残留基准实验室
国家工程（技术）研究中心（3个）
　　微生物农药国家工程研究中心
　　国家家畜工程技术研究中心
　　国家油菜工程技术研究中心
国家育种中心（6个）
　　国家植物基因研究中心（武汉）
　　国家柑橘育种中心
　　国家农作物分子技术育种中心
　　国家果树脱毒种质资源室内保存中心
　　国家油菜武汉改良分中心
　　国家蔬菜改良中心华中分中心
教育部重点实验室（2个）
　　园艺植物生物学教育部重点实验室
　　农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
农业部重点实验室（3个）
　　农业部猪遗传育种重点开放实验室农
　　业部食品安全评价重点开放实验室
　　农业部亚热带农业资源与环境重点开放实验室
湖北省重点实验室（2个）
　　湖北省预防兽医学重点实验室
　　湖北省作物病害监测和安全控制重点实验室
省部研究中心（7个）
　　湖北省柑桔工程技术研究中心
　　湖北省马铃薯工程技术研究中心
　　教育部油菜工程研究中心
　　国家农产品加工技术研发淡水鱼类专业分中心
　　动物生物药物教育部工程研究中心
　　湖北农村发展研究中心
　　湖北省动物疫苗工程技术研究中心
省部级质量检测中心（3个）
　　农业部种猪质量监督检验测试中心（武汉）
　　农业部微生物产品质量监督检验测试中心（武汉）
　　湖北省饲料质量监督检验站
　　校级研究中心与实验室