学院已经建成了设备先进、功能齐全的科研实验中心。中心建筑面积约2250平方米、总资产约1500万元、拥有高效液相色谱仪、核酸序列分析仪等大型仪器设备约90余台，拥有中药药理、中药化学、中药生药3个国家中医药管理局中医药科研三级实验室，中药免疫与分子生物学、中药制剂、生物化学、病理4个国家中医药管理局中医药科研二级实验室。实验中心经甘肃省科技厅、兰州市政府批准，联合相关企业，成立了“甘肃省中药现代化工程技术研发中心”、“兰州中药现代化工程技术研究开发中心”。