武夷学院前身为南平师范高等专科学校，也是800多年前朱熹亲手创建的武夷精舍(书院)的传承者。南平师范高等专科学校于1958年创办，1962年1月组建南平师范学院(本科)，文革期间停办，1978年复办南平师专。2004年7月，学校从南平市搬迁至武夷山市。2007年3月，教育部批准在南平师范高等专科学校的基础上设立武夷学院。